| Page | Description | Tags |
| CAS番号 |
CAS番号は化学物質、ポリマー、生体分子の配列、混合物、合金などを区別するために割り当てられた番号。アメリカ化学学会のChemical Abstracts Service (CAS)部門がこれらの割当を行っている。… |
データベース |
| EBIのWebサービス |
EBIのデータベースは、Webサービスを提供している。データベースエントリの取得や遺伝子やタンパク質配列の解析ができるので、研究に合わせたクライアントプログラムを作成することができる。… |
データベース,
EBI |
| INSD-XML |
塩基配列データベースコンソーシアム、INSDCでのXMLフォーマット。
* INSD Documents
* Feature table
* INSD_V1.4.dtd
(クリック後ダウンロード開始)
* Entrez Utilities Web Service
データベース,
XML… |
データベース,
XML |
| INSDC |
国際塩基配列データベース(International Nucleotide Sequence Database Collaboration)
DDBJ/EMBL/GenBankの三大DNAデータベースの協力機構。塩基配列のアクセションID(accession)の共通化やデータ形式の統一(INSD-XML)など、国際デ… |
データベース,
XML |
| International Programme on Chemical Safety (IPCS) |
* 国際化学物質安全性カード
* <http://www.inchem.org/> 公式サイト (英語)
データベース |
データベース |
| NCBIのWebサービス |
E-Utilitiesを使うことで、アプリケーションでNCBIのデータベースを活用できる。
<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/eutils_help.html>
SOAPサービスも利用できるようになった。
<http://eutils.ncbi.nl… |
NCBI,
データベース |
| PubChem |
米国NCBIの化学物質データベースで、化学構造情報だけでなく、MeSHや生物学的なアッセイ方法、類似化合物などと関連づけられているのが特徴。
* PubChemサイト
下の検索ボックスで直接PubChemのキーワード検索ができます。… |
書き方,
データベース |
| ウィルスの略号一覧 |
ICTV Taxonomy - Index of Viruses
ウィルスの略号一覧
α1ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ
* NCBIのInfluenza Virus Resource
* ICTVdb ウィルス種データベース(NCBI)
データベース,
ウィルス… |
データベース,
ウィルス |
| ソルトレークシティと遺伝学 |
疾患／遺伝子情報の宝庫
アメリカユタ州の州都、ソルトレークシティは自然豊かな街で、2002年冬季オリンピックの開催地として有名。モルモン教の総本山、「テンプルスクウェア」があり、９割以上の市民がモルモン教。… |
遺伝,
データベース |
| データベースへのリンクの作り方 |
このWiki内では、さまざまなデータベースのエントリへ簡単にリンクが張れるようになっています。(Interwiki機構)
通常のリンクのように、[[(リンク)]]のように書きますが、リンクの部分にデータベースとIDを指定すると、データベースのエントリへのリンクが作成されます。… |
書き方,
DokuWiki,
データベース |
| データベース検索 |
遺伝子関連
遺伝子データベースのエントリはDDBJ(日本)、NCBI(米国)、EMBL(欧州)で共有されている。INSDCにより、これら三大データベース間のアクセションIDやデータフォーマットの共通化が図られている。… |
データベース |
| データベース検索 |
* UCSC Genome Browser
* UCSC Genome Browserのホームページ
* US Department of Energy Joint Genome Institute
* Eukaryotic Genomics
* Washington University School… |
データベース |
| ベクターの配列を取得する方法 |
クローニングベクターの配列は、各試薬会社のホームページで得ることができる。しかし、会社ごとにWebページのレイアウトが違うし、迷子になってしまうこともままある。一般的なクローニングベクターは遺伝子データバンクに登録されているので、データバンクから取得する方法を覚えてしまえば、迷子にならずに済むかも知れない。… |
データベース,
DDBJ |
| 今月の分子 |
PDB（タンパク質構造データベース）を運営しているRCSBでD.S. Goodsellが月に一回ある分子の構造を選んで解説しているページ。豊富なイラストとともにタンパク質の機能について分かりやすく解説されている。… |
PDB,
データベース |
| 今月の分子2000 |
RCSB PDBサイトで2000年に紹介された、「今月の分子」
Molecule of the Month - 2000 by D.S. Goodsell
* Myoglobin - ミオグロビン
* Bacteriophage phiX174 - バクテリオファージφX174
* DNA Polymera… |
PDB,
データベース |
| 今月の分子2001 |
RCSB PDBサイトで2001年に紹介された、「今月の分子」
Molecule of the Month - 2001 by D.S. Goodsell
* Alcohol Dehydrogenase - アルコールデヒドロゲナーゼ
* Insulin - インシュリン
* Transfer RNA - … |
PDB,
データベース |
| 今月の分子2002 |
今月の分子2002
RCSB PDBサイトで2002年に紹介された、「今月の分子」
Molecule of the Month - 2002 by D.S. Goodsell
* Thrombin - トロンビン
* Nitrogenase - ニトロゲナーゼ
* Bacteriorhodopsin - … |
PDB,
データベース |
| 今月の分子2003 |
RCSB PDBサイトで2003年に紹介された、「今月の分子」
Molecule of the Month - 2003 by D.S. Goodsell
* Serum Albumin - 血清アルブミン
* Potassium Channels - カリウムチャンネル
* lac Repressor -… |
PDB,
データベース |
| 今月の分子2004 |
RCSB PDBサイトで2004年に紹介された、「今月の分子」
Molecule of the Month - 2004
by D.S. Goodsell
* The Glycolytic Enzymes
* The Calcium Pump
* Growth Hormone by D.S. Goodse… |
PDB,
データベース |
| 今月の分子2005 |
RCSB PDBサイトで2005年に紹介された、「今月の分子」
Molecule of the Month - 2005
by D.S. Goodsell
* Phenylalanine Hydroxylase - フェニルアラニンヒドロキシラーゼ
* Major Histocompatibility Co… |
PDB,
データベース |
| 今月の分子2006 |
RCSB PDBサイトで2006年に紹介された、「今月の分子」
Molecule of the Month - 2006
by D.S. Goodsell
* Topoisomerases
* Alpha-amylase
* Tissue Factor
* Hemagglutinin
* Glucose… |
PDB,
データベース |
| 今月の分子2007 |
RCSB PDBサイトで2007年に紹介された、「今月の分子」
Molecule of the Month - 2007 by D.S. Goodsell
* Importins
* Exosomes
* Zinc Fingers
* Clathrin by G.T. Johnson and D.S. G… |
PDB,
データベース |
| 侵入生物データベース |
ほ乳類鳥類は虫類両生類魚類昆虫類その他の動物維管束植物
独立行政法人 国立環境研究所は日本における侵入生物を調査し、データベースを公開している。
人間の活動によって本来の生息地から離れた場所に持ち込まれた生物が、その土地の固有種を駆逐、淘汰していくことがある。食用として輸入した種や、害獣の補食のために別の土地に放した… |
データベース |
| 原生生物 |
* 原生生物情報サーバ - 原生生物とその他の微生物の画像/動画
データベース |
データベース |
| 国際化学物質安全性カード |
(International Chemical Safety Card, ICSC)
さまざまな業種の雇用者の健康と安全性を守るため、化学物質が人体に与える影響をデータベース化したもの。
WHO(世界保健機関)・UNEP(国連環境計画)・ILO(国際労働機関)の共同事業である、IPCS(国際化学物質安全性計画)が行… |
データベース |
| 有機化合物のスペクトルデータベース |
有機化合物のスペクトルデータベース - SDBS
有機化合物の種々のスペクトル（Mass,13C NMR, 1H NMR, IR, ESR）データベース。
産業技術総合研究所が運営している。1日50件しか閲覧できない。… |
データベース |
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