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| CodonViewer |
CodonViewerは、コドン表を簡単に表示するフリーウェアです。コドンの各塩基の選択や、アミノ酸の選択によって強調表示されます。
また、生物や器官によって異なる17種類のコドン表を選択することができます。生物種・組織ごとのコドン使用頻度の表示が可能になりました。… |
フリーウェア,
アミノ酸,
コドン |
| tRNA |
転移RNA (transfer-RNA)。 3つの塩基配列(コドン)とアミノ酸分子を物理的に対応付けるRNA分子。DNAの情報はmRNAに転写され、その配列に相補するtRNAでアミノ酸配列として翻訳される。
* John G. Arnez and Dino Moras (1999) Transfer R… |
RNA,
タンパク質,
コドン,
アミノ酸 |
| アミノアシルtRNAシンテターゼ |
tRNAはリボソームに達する前にコドンに応じたアミノ酸と結合して準備されてなければいけない。また、コドンとアミノ酸の結合は正確でなければならない。アミノアシルtRNAシンテターゼは、コドンとアミノ酸の適合を担っている重要な酵素である。… |
RNA,
タンパク質,
酵素,
コドン,
アミノ酸 |
| カビ・原生動物・脊椎動物・腔腸動物のミトコンドリア、マイコプラズマ・スピロプラズマのコドン表 [no.4] |
(The Mold, Protozoan, and Coelenterate Mitochondrial Code and Mycoplasma/Spiroplasma Code)
コドン |
コドン |
| コドン表 |
* 画像はCodonViewerを使って作成。
* コドン表のデータはThe Genetic Codes (NCBI)を元に作成。
コドンの使用頻度について
同じアミノ酸であっても、コドンの使用頻度は生物種によって異なる。そのため、他の生物を用いて組み換えタンパク質を発現させる場合には、宿主細胞で使用頻度の高いコ… |
コドン,
アミノ酸 |
| 標準コドン表 [no.1] |
(ユニバーサルコドン、The Standard Code)
通常のコドン表で、transl_tableのIDは1である。GenBankのファイル内では、IDが1の場合transl_tableは省略される。標準コドンでない場合に、qualifierとしてCDS feature内に明示される。開始コドンはAUGである。… |
コドン |
| 無脊椎動物のコドン表 [no.5] |
(The Invertebrate Mitochondrial Code)
コドン |
コドン |
| 繊毛虫類・石灰藻類・ヘキサミタ属のコドン表 [no.6] |
(The Ciliate, Dasycladacean and Hexamita Nuclear Code)
コドン |
コドン |
| 脊椎動物ミトコンドリアのコドン表 [no.2] |
(The Vertebrate Mitochondrial code)
標準コードとの違い
Code 2 Standard AGA Ter * Arg R AGG Ter * Arg R AUA Met M Ile … |
コドン |
| 酵母ミトコンドリアのコドン表 [no.3] |
(The Yeast Mitochondrial code)
コドン |
コドン |
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